Particulièrement discrets, ces animaux sont difficiles à observer. En revanche les nombreuses traces et indices laissés derrière leur passage montrent bien leur présence sur le territoire. Une trentaine d’espèces est connue dans la réserve de la Bassée. Les observateurs pourront voir l’Écureuil roux ou le Hérisson d’Europe, protégés au niveau national, mais aussi le Chevreuil d’Europe ou le Lapin de garenne.

L’Hermine, la Martre et le Renard seront plus difficile à voir.

Parmi les mammifères il ne faut pas oublier les chauves-souris : au total 18 espèces ont été identifiées. Même si la Pipistrelle commune est la plus abondante, d’autres espèces telles que la Noctule commune, le Grand murin ou encore la Pipistrelle de Nathusius peuvent être mentionnées.